第16話は、キャラクターとテーマが深まる重要な章です。強力な指導者として、元・サラリーマンの一級呪術師、七海建人（ななみ けんと）が登場。彼は五条悟とは対照的に、「呪術師は仕事」と断言し、効率的で冷静なプロフェッショナルの姿を虎杖悠仁に示します。一方、都市で暗躍し始めた特級呪霊・真人（まひと）の存在が浮上。彼は自らの「術式」で人間を呪霊に変えるという歪んだ実験を行っており、その脅威が現実のものとなり始めます。新人とベテランの組み合わせが、従来とは次元の異なる“人間性”をめぐる戦いに直面する、物語の新たな局面が開かれます。
第49話で、地方都市の事件調査は危険な局面を迎える。虎杖悠仁たちが追う特級指定呪霊「呪胎・戴天」は、単なる殺戮者ではなく、一定の「領域」を持ち、人間を誘い込んで捕食する高度な知性を持つ。その巣穴と思われる廃ビルに潜入したチームは、犠牲者の亡骸と、呪霊が残した不気味な痕跡を発見する。伏黒の式神による索敵が行われる中、暗闇からは獲物を待つ捕食者の気配が忍び寄る。これは、力による正面衝突ではなく、恐怖と未知との探り合いが続く、緊張感あふれる偵察の章だ。
第48話で、物語は新たな事件「幼魚と逆罰」編へと本格的に突入する。虎杖悠仁、伏黒恵、釘崎野薔薇の三人は、七海建人の指導の下、とある地方都市で発生した連続怪死事件の調査任務に就く。現場には、人間を惨殺した特級指定呪霊「呪胎・戴天」の痕跡が残されていた。これは単純な祓いではなく、一般市民が巻き込まれた猟奇的な事件。新人たちは、初めて「民間人の保護」という最も困難な制約の中で、知能と凶暴性を兼ね備えた未知の呪霊と対峙することになる。
第47話は、交流戦終了後の「日常」と、その裏で動き出す「闇」を描く過渡期の章です。虎杖悠仁たちは平穏な学園生活に戻るが、五条悟は特級呪霊・真人たちの組織「咒霊操術」の本格的な動きを警戒し、次の手を打ち始める。一方、京都校の楽厳寺嘉伸は、虎杖の処分が先送りになったことに不満を募らせる。物語の舞台は学園から外へと広がり、次の大事件である「幼魚と逆罰」編への確かな伏線が張られる。すべての新展開をいち早くキャッチするなら、呪術廻戦 mangarawが最適です。
第39話で、極限の共闘が一つの答えを生む。東堂葵が「不義の愛」を極限まで拡大展開し、虎杖悠仁を空間跳躍させて繰り出す連続攻撃は、ついに花御の防御を突破する。この戦いで、虎杖は東堂の「心の動き」の哲学を完全に体現し、師匠と一心同体とも言える連携を見せる。しかし、その攻撃は花御を倒すには至らず、逆に花御は真の力を解放し、森全体を「領域」に変えようとする気配を見せる。戦いは新たな、そしてより危険な局面を迎えようとする中、戦場全体を掌握する「ある人物」の視線が、この異変を捉える。
第9話で、五条悟の導きにより渋谷に足を踏み入れた虎杖悠仁と釘崎野薔薇は、日常に溶け込む「呪い」の現実を目の当たりにする。超高層ビルの雑踏、地下鉄の暗がり──無意識に生み出される人々の負の感情が、具体化した低級呪霊として蠢く。これは単なる実地訓練ではない。最強の教師が用意した、都市を呪術の戦場として認識させる最初の授業だ。喧騒の街中で二人は初の共同戦闘を開始し、それぞれの術式の特性を活かした連携の基礎を築いていく。巨大な迷宮・渋谷での、チームとしての第一歩が刻まれる。
第46話で、姉妹校交流戦「呪術チーム競技」の勝敗がついに決する。最終局面での直接対決を制したのは、虎杖悠仁たちの東京校チームだった。互いの全力を出し切った両チームに、勝者への称賛と敗者への敬意が生まれる。加茂憲紀は潔く結果を受け入れ、究極メカ丸は自身の成長を実感する。これをもって、全ての競技が終了し、交流戦は幕を閉じる。物語は、戦いを通じて深まった絆と、次の舞台への期待を残し、ひとつの大きな区切りを迎えるのである。