第133話で、迷路の戦いはさらに複雑に。呪霊の群れを倒した直後、迷路の構造そのものが変化し、虎杖と伏黒は別々の通路に分断されてしまう。孤立した伏黒は、管理者の術式の一端に気付く——この空間は、侵入者の「孤独」や「不安」を増幅させる効果を持っていた。一方、虎杖は迷路の壁を力任せに破壊しながら進もうとするが、壊れた壁は瞬時に再生する。二人は、離れていても互いを信じ、それぞれの方法で迷路の核心と管理者の居場所を探り始める。次第に、このゲームの本当の目的が見えつつある。
第82話は、戦いの後処理と新たな現実が描かれる章です。領域が消滅し、現実に戻ったチームは、傷の手当てと被害状況の確認に追われます。乙骨憂太は、他の区域でも同様のゲームが進行していることを告げ、チームを離れて次の任務へ向かいます。一方、五条悟から連絡があり、今回の事件が敵組織の本格的な「宣言」であったことが明かされます。ほっとする間もなく、次のより広大な戦いの予感が訪れる。一つの勝利は終わりではなく、全体戦争のほんの序章でしかないことを、彼らは思い知らされるのでした。
第13話は、嵐の前の静けさと新たなる日常の始まりを描く。渋谷での実戦研修を経て高専へ戻った虎杖悠仁と釘崎野薔薇は、正式な「呪術師」としての日々を歩み始める。教室では五条悟による理論授業が行われ、かつては異質だった呪力の操作が、少しずつ馴染みある感覚へと変わりつつある。しかし平穏の裏側で、伏黒がもたらすある「噂」は、東京と京都の姉妹校がしのぎを削る「交流戦」という、新たな戦いの予感を告げる。静かな学園生活の一幕が、次の大きな騒動への伏線として機能する、穏やかながらも確実に物語が前進する調整の章だ。
第92話は、防衛戦の決着と、突然の“力”の介入が描かれる章です。数の暴力に押されつつあった虎杖悠仁たちの前に、突如として謎の援軍が現れる。それは、ゲームの参加者を名乗るものの、その実力は特級に匹敵する、呪詛師・麗美（うるみ）だった。彼女の介入により敵部隊は一時撤退を余儀なくされる。しかし、彼女が示した手の甲の「死滅回游」の刻印は、両面宿儺がかつて所有していたものと酷似していた。新たな謎の登場は危機を救ったが、その背後には、宿儺とこのゲームを巡るさらに深い因縁が潜んでいることを示唆する。
伏黒は詐欺師である黄櫨の仕掛けた罠にはまり、そのまま激しい戦闘へ突入する。黄櫨は卑怯な手段で伏黒を追い詰めていくが、伏黒も冷静さを失わず、わずかな隙を見極めて反撃していく。一方その頃、虎杖は少しずつ日車へと近づいており、二人の距離が徐々に縮まっていく回となっている。
第155話で、全てが決する瞬間が訪れます。虎杖の疾走と同時に、宿儺の体内で伏黒の魂が一瞬だけ目覚め、宿儺の動きを封じます。その刹那、五条、乙骨、そして全ての力を振り絞った虎杖の最後の一撃が、宿儺の根源を貫きます。圧倒的な呪力の奔流が収まり、静寂が訪れます。戦いが終わり、崩れかけた世界に、かすかな光が差し込み始めました。
第30話は、「廻り舞台の戦い」における虎杖悠仁・釘崎野薔薇チームと究極メカ丸の決戦の決着編です。メカ丸の機動兵器「究極丸」の猛攻に対し、虎杖の肉体的な強靭さが盾となり、釘崎が「共鳴」の術を正確に命中させるという、二人の連携が勝利への鍵となります。戦いを通じて、メカ丸は自身の“弱さ”を認めると同時に、真剣に戦うことの意味を体得していきます。一方、戦場の別の区域では、京都校の禪院真依と西宮桃が行動を開始し、静かに近づく新たな脅威の気配が示されます。一つの戦いが終わり、交流戦はより複雑な様相を呈し始める過渡期の章です。