第31話は、激闘後の沈黙と新たな駆け引きが支配する。究極メカ丸との戦いを終えた虎杖悠仁と釘崎野薔薇は、戦場で息を整える。一方、密林の別の場所では、京都校の禪院真依が単独行動を続け、西宮桃の空からの支援を受けて東京校の生徒を執拗に追跡・排除する作戦を実行中だ。そのターゲットは、熊猫と狗巻棘。真依の「呪銃」による狙撃と、西宮の飛行能力による広域制圧という危険なコンビネーションが、経験豊富な二年生たちをも脅かす。交流戦は、個人の実力だけではなく、戦略と情報戦の様相を強めていく。
第104話は、新たな環境「水上都市」での適応と最初の交戦を描く。管理者烏鷺の配下である半機械的な呪霊の群れは、水中からの奇襲と連携攻撃を仕掛けてくる。虎杖悠仁と禪院真希が陸上での迎撃を担当し、伏黒恵が新たな水生式神を試みて水路の制御を図る。一方、釘崎野薔薇は高所から戦場を俯瞰し、敵のパターンと「核心」を見つけ出そうとする。複雑な地形を活かした戦いが展開される中、区域の中心にある塔からは、烏鷺が優雅に、しかし冷徹にこの「芸術作品」を鑑賞する視線が注がれている。
第12話で、渋谷研修は予期せぬ形で終幕を迎える。数々の呪霊を祓い、手ごたえを感じ始めた虎杖悠仁と釘崎野薔薇の前に、突如として強大な「一級呪霊」が姿を現す。圧倒的な敵に互いを守りながら奮闘する二人。その絶対的な力の差は、彼らがまだ「特級」や「一級」と呼ばれる世界の入り口に立ったに過ぎないことを痛感させる。窮地を救うため、五条悟が遂に本気の一片を見せる。その一瞬の介入は、新人たちに、己が目指すべき「強さ」の頂点がいかなるものかを、言葉ではなく実感として焼き付ける。格の違いを学び、新たな目標を得て、彼らの日常は再び動き出す。
第251话，五月的傍晚。虎杖路过小学，帮摔倒的小孩捡起书包。小孩跑向妈妈，头也不回。他站了一会儿，想起自己也这样跑过。回高专时顺路买了布丁。伏黑埋头写报告，头也不抬说“回来了”。虎杖放一个在他桌上。钉崎推门进来，抢布丁，三个人闹成一团。窗外夕阳很暖。只是又一个普通的日子。
第66話で、物語の舞台は「死滅回游」の本戦区域へと急展開する。五条悟の指示により、虎杖悠仁、伏黒恵、釘崎野薔薇、そして新たな決意を胸にした禪院真希らが、ゲームが発生した地区へと急行する。到着した彼らが見たのは、通常の街並みが、奇怪なルールと強大な呪力で歪められた異様な空間だった。すでに内部では参加者同士の殺し合いが始まっており、空中には不気味な「管理者」の姿が浮かぶ。生存者救出とゲーム破壊を目指し、チームは未知の戦場へと突入する。
第238话，一个普通的周末。钉崎拉着伏黑和虎杖去逛商场，说春天到了必须买新衣服。伏黑一脸不情愿，但还是被拖进店里。虎杖在试衣间外等着，无聊地刷着手机，偶尔抬头吐槽钉崎选的衬衫太花哨。最后三人拎着购物袋，在美食广场吃着便宜的拉面。钉崎抱怨伏黑审美太保守，伏黑反驳她品味太夸张，虎杖埋头吃面，偶尔抬头傻笑两声。窗外樱花正开，风吹过时花瓣贴在玻璃上。很吵，很普通，很日常。真好。
第38話は、特級の呪霊・花御との戦いが、想像を絶する次元で繰り広げられる章です。東堂葵と虎杖悠仁の連携攻撃も、花御が森そのものを活性化させて作り出す巨大な植物障壁と怒涛の攻撃の前では通用しない。花御は言葉を発さずとも、「自然」の理不尽なまでの豊穣と破壊の力を体現し、二人を追い詰めます。絶体絶命の危機の中、東堂は自らの最終手段とも言える術式「不義の愛・拡大展開」を発動することを決意。虎杖の潜在能力を引き出すための「心の動き」の授業は終わり、今や生死をかけた極限の共闘が求められます。